تي بلازميد
تُعَرَّفُ تي بلازميد (بالإنجليزية: Ti plasmid) على أنها بلازميدٍ دائريٍ غالباً وليس دائماً ما يكون جزءً من آلةٍ أو مُعِدَّةٍ وراثيةٍ تستخدمها الأجرعية المورمة (بالإنجليزية: Agrobacterium tumefaciens) وAgrobacterium rhizogenes لتحويل مادتها الوراثية لأى النباتات. إلا أن التي بلازميد يُفْقَدُ عندما تنمو الاجرعية (بالإنجليزية: Agrobacterium)فوق درجة حرارة 28 درجةً مئويةً. إلا أنه يجب ملاحظة أن مثل تلك البكتريا المعالَجَة لا تحث أو تستميل أورام الصفراوات المتوجة، وللتوضيح فهي تصبح غير سامةٍ. هذا وتتشارك كلٌ من pTi و pRi في تناغمٍ ضعيف التسلسل إلا أنهما بدلاً من ذلك متشابهان وظيفياً. ويُصَنَفُ التي بلازميد إلى أنواعٍ مختلفةٍ فرعيةٍ مبنية على نوع الأوبين (بالإنجليزية: opine) الذي تنتجه جيناتها. وتتمثل الأوبينات المختلفة والتي تحددها pTi في octopine، nopaline، succinamopine، وleucinopine.
وللبلازميد 196 جيناتٍ (مورثاتٍ) والتي تمثل شفرة 195 من البروتينات. إلا أنه لا يوجد له أي حمض ريبي نووي RNA. ويصل طول البلازميد إلى 206,479 نوكليوتيدات، في حين يصل محتوى الجانين-سيتوزين (بالإنجليزية: guanine-cytosine content) إلى 56% و81% من المادة هو عبارة عن جينات مشفرة. كما أنه لا يوجد أي جيناتٍ زائفةٍ (بالإنجليزية: pseudogenes).
منطقة الفوعة
تجتمع الجينات في منطقة الفوعة داخل منطقة مشاغل virABCDEFG والتي تُسَفِّر مثل تلك الإنزيمات المسؤولة عن مسألة التحول التوسطي للـ T-DNA إلى الخلايا النباتية. [1]
- يُسَفِّرُ virA المستقبل والذي يتفاعل في وجود مركبات متعدد الفينول مثل acetosyringone، [2] syringealdehyde أو acetovanillone [3] والتي تتشرب من أنسجة النبات التالفة. [4]
- تشفر virB البروتينات التي تنتج الهياكل والتركيبات المسامية/ المحببة الشكل. [2]
- تربط virC التسلسل السريع. [2]
- يُنتج كلٌ من virD1 و virD2 الإندوكليوسات والتي تستهدف حدود التكرار المباشر لقطعة أو جزئية T-DNA، [2] بدءً من الحد الأيمن. [4]
- يُنَشِّط virG من استخلاص جين الفيروس (بالإنجليزية: vir-gene) بعد الارتباط بالتسلسل التوافقي،[2] وذلك بمجرد فسفرته بواسطة virA. [4]
المصادر
- ↑ Scott E.Stachelt, Eugene W.Nester (1986). "The genetic and transcriptional organization of the vir region of the A6 Ti plasmid of Agrobacterium tumefaciens". The EMBO Journal. 5 (7): 1445–1454. PMC 1166964
. PMID 3017694.
- ↑ 2٫0 2٫1 2٫2 2٫3 2٫4 Schrammeijer, B., Beijersbergen, A., Idler, K.B., Melchers, L.S., Thompson, D.V., Hooykaas, P.J.J. (2000). "Sequence analysis of the vir-region from Agrobacterium tumefaciens octopine Ti plasmid pTi15955". Journal of Experimental Botany. 51 (347): 1167–1169. PMID 10948245. doi:10.1093/jexbot/51.347.1167.
- ↑ Reconstitution of Acetosyringone-Mediated Agrobacterium tumefaciens Virulence Gene Expression in the Heterologous Host Escherichia coli. Scott M. Lohrke, Hongjiang Yang, and Shouguang Jin, J Bacteriol. 2001 June; 183(12): 3704–3711, doi:10.1128/JB.183.12.3704-3711.2001
- ↑ 4٫0 4٫1 4٫2 Alexander N. Glazer, Hiroshi Nikaidō (2007). Microbial biotechnology: fundamentals of applied microbiology. Cambridge University Press. ISBN 0521842107.